А какую сумму (стоимость квартиры) вы указывали? Ведь поскольку оплачена не вся стоимость квартиры, то реально подтвердить расходы (т.е. платежи) мы можем только частично. И как вы доли вычета определяли: равные или по желанию (например, одному 30% , другому 70%)?
Налоговая декларация 3-НДФЛ включает заполнение бланка, где указывается реальная сумма, ушедшая на выкуп кв.м., подтвержденная платежными квитанциями. Далее, приносите справку 2-НДФЛ с работы, где указаны налоговые удержания с зарплаты. Если у вас зарплата за год не превысит сумму вложений за квартиру, вам вернут все налоги, а если вы так много заработали, то вернут налоги той части зарплаты, которая равна вложениям. Через год все эти сведения будут учитываться уже в новой декларации 3-НДФЛ, до тех пор, пока вложения не достигнут 1 млн и, соответственно, не заработаете 1 млн, что позволит вернуть в сумме 130 000 р.
Что касается долей, у меня в этой части нет проблем, у меня доля - 1.