Как не стоит, стоит, еще как стоит. Просто в разыне разделы надо ставить. У меня на старом ноуте 40Гб винта, 25Гб под раздел виндоса, 15 Гб на три раздела линюкса: 1. Системный раздел; 2. Раздел под документы; 3. Своп раздел, размер которого равен двойному размеру оперативной памяти.
Уверяю, линюкс виндосу не мешает, виндос линюксу не мешает. Линюкс видит раздели виндоса, виндос не видит разделы линюкса, так как виндос не в состоянии видеть фаловую систему ext2