По программе МС бюджет - не бюджет, не имеет значения (как и место дислакации работы), главное - казанская прописка и заработок не меньше прожиточного минимума. Когда мы вставали на учет, муж тоже в московской фирме работал и трудовая у него в Москве была. Заказным письмом все справки получали и 2-НДФЛ тоже из Москвы (здесь фирма не зарегистрирована). Все документы у нас приняли, никаких претензий не возникло.